Что такое «дельта» -штамм и нужно ли его бояться? Разбираемся, что происходит с мутациями коронавируса

За мутациями коронавируса следят ученые во всем мире (например, в системе GISAID). Также Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) собирает и анализирует эту информацию. В конце 2020 года среди штаммов вируса стали выделять так называемые варианты, представляющие интерес (variants of interest, VOIs), и варианты, вызывающие беспокойство (variants of concern, VOCs).

Раньше в СМИ и в обиходе использовалась либо научная номенклатура для названия вариантов (которая представляет собой сочетание букв и цифр), либо наименование по стране, где впервые был обнаружен тот или иной вариант. Но ВОЗ считает наименование по стране дискриминирующим, поэтому с июня для названия различных вариантов вне научной среды используют буквы греческого алфавита — «альфа», «бета», «гамма», «дельта» и так далее.

Вариант, представляющий интерес (VOI), — это вирус, у которого произошли такие изменения в геноме, что они влияют на ключевые параметры: заразность, тяжесть течения ковида, ускользание от иммунного ответа, ускользание от диагностики или лечения. Чтобы какой-то вариант вируса назвали представляющим интерес, нужно еще несколько условий:

— в разных странах уже должны быть зафиксированы случаи высокого уровня передачи этого варианта в сообществах;

— также должно расти число случаев с этим вариантом — как абсолютное, так и относительное (когда сравнивают между собой разные варианты коронавируса).

Вариант, вызывающий беспокойство (VOC), во-первых, отвечает всем условиям, которые выдвигаются для варианта, представляющего интерес. Также для этого варианта обязательно одно из трех:

(*Вирулентность — это такая характеристика, которая показывает, насколько тяжело протекает заболевание у тех, у кого есть симптомы этого заболевания. Вирулентность — это отношение числа серьезных или смертельных случаев к общему числу случаев с клинической картиной заболевания.)

Также ВОЗ создала список для мониторинга тех вариантов, которые пока нельзя включить по критериям ни в список тех, что вызывают беспокойство, ни в список тех, что вызывают интерес. В списке для мониторинга оказываются варианты, которые могут представлять риск в будущем. Буквы греческого алфавита в списке для мониторинга не задаются — для этих вариантов используется лишь научная номенклатура.

В начале июля появились новости о том, что в списке для мониторинга, где числятся двенадцать вариантов, оказался и вариант AT.1, который впервые был обнаружен в России в январе 2021 года.

Отслеживать различные варианты в России можно на сайте taxameter.ru, который создан лабораторией Георгия Базыкина (Сколтех и ИППИ РАН) совместно с Российским консорциумом по секвенированию геномов коронавируса (CORGI). Большая часть открытых данных о геномах коронавируса — это данные для Санкт-Петербурга.

Впрочем, как отмечают сами создатели карты, геномы коронавируса изучаются в России мало, и различные варианты попадают в базу данных с разной вероятностью, поэтому, к сожалению, нельзя сказать, что на сайте дана представительная выборка. На официальном сайте НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора с информацией о геномах вирусов данных в открытом доступе нет, поэтому говорить об открытых государственных данных не приходится.

Первые образцы варианта «дельта» были впервые обнаружены в Индии в октябре 2020 года. Этот вирус был ответственен за весеннюю катастрофу в Индии, когда, только по официальным данным с 8 марта по 15 июля 2021 года, умерло 254 233 человека (а вообще эксперты говорят о том, что данные о заболеваемости и смертности в Индии занижаются). При этом за все время с начала пандемии до 7 марта в Индии умерло 157 756 человек, то есть за прошедшие четыре месяца от ковида в Индии умерло на 60% больше людей, чем за все время до этого.

Вариант «дельта» появился в Индии и распространился в Европе, Северной Америке, Австралии, а также в Африке и Южной Америке. В России первый образец был зарегистрирован 7 апреля. В предыдущем материале мы приводили официальную российскую статистику по заболеваемости ковидом и смертности от него, что позволяет говорить о новом значительном подъеме.

По британским данным, индекс репродукции (показатель заразности) для тех людей, у которых нет иммунитета к коронавирусу, у штамма «дельта» составляет от 3,3 до 10 (нам неизвестны такие данные для России). А в актуальной версии британского плана действий в ближайшее время предусмотрено три сценария развития событий: когда индекс репродукции после снятия ограничений будет равен 5,5 (средний), 4,5 (низкий) или 7 (высокий).

В целом штамм «дельта» вдвое более заразный, чем другие варианты, не относящиеся к числу вызывающих беспокойство или представляющих интерес. Судя по препринту британского исследования — предварительной версии научной публикации, которая еще не прошла рецензию, — вариант «дельта» менее чувствителен к нейтрализующим антителам (тем, что связываются с вирусом и не дают ему проникнуть в клетки) у тех, кто уже перенес инфекцию ранее.

Также вариант «дельта» лучше других вариантов реплицируется (размножается) в клетках дыхательных путей, что может вызвать более сильную инфекцию. Кроме того, в этом и другом препринте говорится о том, что варианту «дельта» легче проникать в клетки человека. Это связано с тем, что в S-белке варианта «дельта» произошла мутация, которая облегчает его разрезание. Наконец, именно вариант «дельта» отвечал за большую часть инфекций прорыва (тех инфекций, которые случились, несмотря на вакцинацию) у медицинских работников в двух больницах в Дели, где занято полторы тысячи человек.

Из тех вариантов коронавируса, что присутствуют в России и относятся к числу вызывающих беспокойство, варианты «альфа» и «бета» имеют похожие эффективные индексы репродукции (показатели заразности). Однако оба они, включая также варианты, представляющие интерес, «эта» и «йота», примерно на 25–35% более заразны, чем остальные варианты коронавируса. А вариант «дельта», о котором мы рассказывали в предыдущем материале, и вовсе вдвое заразнее, чем варианты коронавируса, не относящиеся к числу вызывающих беспокойство или представляющих интерес.

В статье, опубликованной в «Международном журнале инфекционных заболеваний» (International Journal of Infectious Diseases), посвященной включению прививок от ковида в программу вакцинации детей, говорится: «Появление вариантов, вызывающих беспокойство, происходит благодаря циркуляции вирусов в людях, не имеющих иммунитета к коронавирусу, и давлению отбора со стороны иммунитета у людей, которые перенесли инфекцию раньше или привились. Следовательно, снижение числа резервуаров для вируса будет ключевым моментом, чтобы снизить способность вируса мутировать».